Die Abteilung Finanzbuchhaltung ist verantwortlich für die Führung der Staatsbuchhaltung. In dieser Aufgabe ist sie zuständig für den Zahlungsverkehr, die Debitoren- und Kreditorenbewirtschaftung, das Inkasso- und Betreibungswesen sowie die Rechnungslegung. In ihren Aufgabenbereich gehört auch die Liquiditätsbewirtschaftung.

Mit der Gerichtskasse ist sie zudem verantwortlich für das Inkasso zugunsten der Gerichtsbehörden und der Staatsanwaltschaft.