Die Arbeit des Departements Gesundheit und Soziales wird von verschiedenen Kommissionen unterstützt und ergänzt. Einerseits handelt es sich um fünf regierungsrätliche Kommissionen (nachfolgend mit "RR" gekennzeichnet). Die Mitglieder dieser Kommissionen werden vom Regierungsrat gewählt. Andererseits ist eine Komission vom Departement selber eingesetzt worden.

• Ethikrat (RR)
• Heilpraktikerinnen-/Heilpraktiker-Prüfungskommission
• Honorarprüfungs- und Schlichtungskommission für Zahnärzte und Heilpraktiker (RR)
• Kommission für Suchtfragen Appenzell Ausserrhoden (RR)
• Gesundheitsrat (RR)