Das Veterinäramt überwacht die Einhaltung der gesetzlichen Vorgaben im Veterinärwesen und rund um Tierhaltungen. Es erfüllt diese Aufgaben sowohl für Appenzell Ausserrhoden wie auch für Appenzell Innerrhoden. Dabei orientiert es sich am Wohl der Tiere sowie am Schutz des Menschen vor Beeinträchtigungen der Gesundheit, die von Tieren oder von tierischen Produkten ausgehen können. Es sorgt insbesondere für den Vollzug der Tierseuchengesetzgebung, der Tierschutzgesetzgebung, der Lebensmittelgesetzgebung sowie der Heilmittelgesetzgebung im Bereich der Tierarzneimittel. Zudem obliegt dem Amt der Vollzug der kantonalen Hundegesetzgebung.